Из-за наличия факторов, не представленных в модели, последнюю иногда вообще не подвергают верификации на некоторых типах пищевых продуктов. Реальные пищевые продукты намного сложнее экспериментальных бульонов — в них работают и другие факторы, влияющие на рост микроорганизмов — в частности структура продукта, наличие дополнительных противомикробных системы (естественно присутствующих пли внесенных консервантов, кислот, различный состав газовой среды при храпении) и присутствие микроорганизмов-конкурентов. Все эти факторы обычно делают прогностические модели более безопасными. Кроме того, во многих моделях определен диапазон условий, использовавшихся при их создании. Несмотря па то что зачастую предполагается пригодность всех комбинаций условий для верификации, в действительности область интерполяции (МСР) модели может оказаться значительно меньше, и, соответственно, результаты верификации модели оказываются неудовлетворительными. Здесь очень важен выбор подкислителя. При разработке многих моделей используют соляную (хлороводородную) кислоту, тогда как в рецептуру пищевых продуктов входят органические кислоты, вносящие свой вклад в значение рН, не учтенный в модели.
Процесс верификации зачастую имеет целью определить границы области применения модели. Области, в которых верификация дает не очень хорошие результаты, очень важны для определения будущих направлений экспериментов.